je pense qu'évaluer en début de palier permet de mettre en place un PPRE dés le début de l'année et ainsi éviter que le maintien dans le cycle en fin d'année... ça revient à s'occuper des difficultés avant que les élèves soient complètement largués, ce qui me parait plus logique.

Ce qui revient à dire qu'une fois les difficultés repérées, on avait les trois ans du cycle pour y remédier et maintenant une seulement.

Oui, tout ça n'est pas très logique. On est censé s'apercevoir qu'un élève est en difficulté ou progresse trop lentement par rapport à la norme, à tout moment, pour intervenir le plus tôt possible (et pas uniquement au CE1 ou au CM2). Avec quels outils on repère ça? des évaluations nationales? il en faudrait à faire passer quasiment chaque trimestre tous les ans, si on veut être sûr de ne pas passer à côté de qqchose d'important, et pas une fois tous les 3 ans ; parce que une fois tous les 3 ans, c'est ou trop tôt (les difficultés ou retards peuvent ne pas être encore apparus, ou pas de manière significative), ou trop tard (il ne reste plus qu'une petite année pour réagir).